管理政府产业基金是金投公司的重要工作。主要是负责组建基金公司，筛选拟合作基金管理人，开展尽职调查、协议谈判、投后管理等工作，起到引导社会资本，推动创业资本集聚，促进本地经济结构调整和产业升级的作用。目前金投公司参股、控股各类产业基金共11支，规模84.32亿元，完成对外投资10.6亿元，带动社会资本投资236.2亿元。其中基金的合作对象包括了平安集团、上汽集团、兴业银行、天堂硅谷、谱润投资等国内具有一定影响力的机构。目前正在洽谈与国投创新、天台县政府等合作的各类引导基金，规模预计超过45亿元。
重点投向：各产业基金重点投向信息经济、环保、健康、旅游、时尚、金融、**装备制造等浙江省七大重大发展产业，以及生物医药、海洋新兴、新材料、新能源等符合市战略新兴产业发展规划的领域。紧密围绕汽摩配、塑料模具、医药化工等十大支柱产，支持和打造更多龙头企业。
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